- 主人公·有马拓也幼年丧母，身为历史学者的父亲也在两个月前因事故去世。在各个方面都失去了活力的高中最后的暑假。某天，他收到了装有镶嵌着用途不明的圆镜和玻璃珠的奇妙物体的小包裹。一起送来的信中有着令人想到父亲还活着的内容……？！“今晚10点，带着这个东西到剑之岬（三角山）来。”他按照指示前往那个地点，却发现神秘的女性倒在那里…
- “这样的时间，若能一直持续下去就好了——。”结束了与第8张职阶卡片的英灵之间战斗的伊莉雅等人。为了尽情享受所剩不多的暑假，她们再次进入度假模式。但，这样的日常，过于轻易地被打破。在奔向发生异变的圆藏山的伊莉雅等人面前出现的脱离现实的人影。在突然的交战之后，空间震动。之后，在震动结束后，伊莉雅醒来所见到的是，隆冬的冬木市…
宇宙联邦搜查官巴迪·希冯为追寻神秘大规模杀伤武器「伦加」而来到地球，但在一次搜查行动中，却误把地球少年千川勉的身体组织破坏。巴迪惟有用自我的躯体暂时安置功的精神意识，在功的身体复原之前，他们俩过上了“二心同体、吴越同舟”的共同生活。而随着时间的推移，地球正面临着巨大的危机当中，他们要怎么化解这场浩劫？