当熊猫阿宝为成为真正的神龙大侠做准备的时候，他的生父——熊猫李山突然到访。与此同时，拥有神秘力量的反派天煞登场，妄图制服所有高手，统治武林。相传在与世隔绝的熊猫村有着对抗天煞的力量，为了拯救苍生，阿宝与父亲踏上了归途，而阿宝的好伙伴悍娇虎、金猴、灵蛇、螳螂则一同拖延天煞，阿宝不仅肩负着成为真正的熊猫大侠的使命，还要让村…

熊猫阿宝终于美梦成真成为了神龙大侠，跟随功夫大师与盖世五侠：悍娇虎、猴王、快螳螂、俏小龙、灵鹤一起保护着和平谷、过着宁静的生活。然而，好景不长，有个邪恶的坏人沈王爷Lord Shen正打算用无人能挡的机密武器征服中国并且毁灭功夫，阿宝面临着一次新的、更加可怕的挑战，在羊仙姑的指引下，他必须回首过去并揭开自身的生世之谜，才能找到…