在第四季中，飞天小女警继续应对小镇维尔的荒谬和搞笑的威胁，同时她们作为年轻超级英雄的生活变得更加复杂。在面对新旧反派，如莫乔乔乔、毛茸茸和神秘的新反派赛杜萨时，三姐妹迎接更大的挑战，这些挑战考验着她们的力量和友谊。本季还更深入地探讨了她们的个人生活，许多剧集讲述了她们的成长、与家人和朋友的关系，以及在打击犯罪和上学之间…

当危机笼罩在小镇维尔时，泡泡、花花和毛毛接到召唤：飞天小女警！在她们的导师尤托尼姆教授的悉心指导下，三姐妹与各种各样的恶行反派展开激烈对抗，在睡前拯救世界。飞天小女警第三季是三个超级英雄，她们在上学、打击犯罪、跳格子游戏和睡前拯救世界之间交替进行。市长召唤她们用超能力对抗罪犯。