宇宙世纪0079年，就连宇宙都变成了人类的战场。势如破竹的吉翁军进行了导致世界人口半数死亡的不列颠作战（殖民星坠落）。另一方面，地球联邦军为了挽回劣势以压倒性战力来对抗。萨比家错综的阴谋、被难以改变的命运玩弄于掌心的雪拉‧玛斯、成为吉翁军驾驶员的兰巴･拉尔及哈蒙，就连在SIDE 7 平稳过日的阿姆罗和芙劳的日常生活，也逐渐蒙上了…

在「破晓起义」后前往地球的夏亚，在那与拥有不可思议力量的少女──拉拉．逊相遇。另一方面，致力推动RX-78开发计划的阿姆罗父亲──提姆･雷，得到吉翁方面MS开发计划的核心人物──米诺夫斯基博士逃亡的消息，因而动身前往月球。在月球表面上的微光区域，展开人类史上首次的MS死斗战。时间来到宇宙世纪0079年——。距离地球最远的宇宙都市S…

川口名人和亚伦．亚当斯为了测试对战系统新安装的自动操纵模式，来到矢岛企业的研究开发室。自动操纵模式是使用历代高达作品中登场驾驶员的模拟人格AI，让不懂操作技巧的人也能轻易进行高达模型对战，是一种划时代模式。名人使用惊异渣古的后继机弹道渣古，亚伦则使用再生高达的特装机逆生高达。两人各自选择了AI，即将展开一场梦幻般的高达模型…

过去篇共6话，终于迎来了完结——。故事发生在宇宙世纪 0079 年 1 月 23 日，吉翁与地球联邦间一决雌雄的战争，终于在 SIDE 5 鲁姆爆发。在战争中被逼入绝境的吉翁，手中握有秘密武器。就是用人型兵器「MS」所组成的特别突击大队，让战况一举逆转并大获全胜。当中，隶属吉翁军的夏亚・阿兹那布尔，驾驶着「萨克Ⅱ」立下战积并因此晋升为少校，更…

宇宙世纪0074年。离开了德克萨斯殖民卫星的爱德华･玛斯，伪装自己的身分，以夏亚･阿兹那布尔之名，进入吉翁共和国国防军官学校就读。而与同届的扎比家少爷、卡尔马交情交深的夏亚，两人逐渐两人逐渐受到学生们的推崇。宇宙世纪0077年。终于，学生们以独立为号召，对地球联邦军治安部队展开武装起义。但那也正是揭开夏亚誓言复仇的华丽剧本序幕…