有一颗陨石落到涩谷后，从陨石中出现了不明宇宙生物异虫，它们变成人类的样子生活在城市中，不断杀害人类。为了消灭这些异虫，人类成立了一个秘密组织杰特，该组织开发出了假面骑士系统。某一天，杰特的实习队员加贺美新，遇到了一名古怪的男子天道总司，他称自己是“行天之道，总司一切的男人”。就在加贺美新以为自己能得到甲斗王变身器的认可…

在未知生命体全部被消灭后的两年，人类迎来了短暂的和平。但海滩上突然出现的神秘欧帕兹，打破了这一和平。城市中再度出现了人类离奇死亡的案件，这次残杀人们的凶手是新的敌人——不明物体。它们拥有着人类无法匹敌的神秘力量，就连专门为之成立的G3小队也对它们毫无办法。失去记忆的开朗少年津上翔一，暂住在美杉教授家中，与美杉教授的侄女风…

一个倒霉到家的少年野上良太郎，因为意外被不良少年们缠上，也因此无意间捡到了叶奈所遗失的通行证，路上又被异魔神悄悄附身。机缘巧合下良太郎打开了通往时间列车的门，并且遇上了列车员直美却觉得没有异状..... 之后叶奈告诉良太郎关于特异点以及电王的事情，他们遇上了被异魔神附身的不良少年...良太郎与众异魔神共同战斗、搞笑、悲伤的故事…

2002年日本发生多宗奇怪的人口失踪案，实习记者城户真司为了调查此事，前往其中一个受害者的家中调查，并在房间内发现了一个名为卡片套匣的道具。为了阻止镜中怪物袭击人类，真司情急之下使用卡片套匣的力量变身为假面骑士前往了怪物所在的镜中世界，并认识了另一位假面骑士秋山莲和神崎士郎的妹妹神崎优衣。随后真司才得知了卡片套匣的秘密以及…

一万年前的极限战争中，代表人类祖先的不死生物，封印了其他52只不死生物后，获得了最终胜利，人类从此得以在地球上繁衍生息。而21世纪的现在，封印被破解，这些不死生物再次苏醒了。为了阻止它们破坏人类的世界，BOARD（人类基盘史研究所）的所长乌丸开发出了假面骑士系统，用来封印那些不死生物。橘朔也和剑崎一真使用腰带变身成为假面骑士星…

本乡猛是城南大学的一名研究员，他拥有聪明的头脑，有着光明的未来。有一天，邪恶组织修卡的成员突然出现在了他的面前，并将他抓走，把他改造成了拥有蝗虫能力的蝗虫怪人。他沉迷于自己的力量，在暗中破坏着这个世界。但在一次行动中，他看见了自己曾经研究的雪花，从而清醒了过来，恢复了正常的神智。杂志记者绿川明日香与她的未婚夫矢野克彦一…