故事的主人公藤原拓海是个普通的高中男生，拥有无与伦比的飞车天赋。从中一开始，每天早上驾驶那辆AE86在秋名山上飞驰，练成了华丽(注意：是华丽)的驾驶技术。必须注意，他的车技之所以高明，是有赖于每天凌晨必须将父亲做的豆腐送到秋名山山顶的饭店。无论刮风、下雨、下雪，五年间车技竟然突飞猛进。

这部主要讲述梦想和前途。同场飙技的伙伴们在高中毕业后各自工作，有的去东京打工，有的在加油站工作。故事的主人公拓海最后选择了边工作边飞车，正职是运输公司的司机，同时加入了赤诚Red Sun车队，并为“改写各地的记录，留下传说”而奋斗。

《头文字D》的第二部着重突出拓海的成长，当然不乏激烈的挑战。最经典的要数赤诚和依吕波山路两位老大的比拼。年轻的拓海在爱情上触了礁，在输给帝王车队的lanEvo 3后，拓海遇到了人生的挫折，对自己和AE86产生了怀疑，AE86真的有足够的实力吗？AE86的重生来自拓海的爸爸文太，他为AE86改装了车用引擎。同时，拓海遇到了同样是AE86的强劲对…

当积雪完全融化后，关东地区的飚车手之间渐渐流传起了一个传闻，在Internet上出现了一个由群马的飚车手所建立的网站，向整个关东地区征集对手并扬言要达成“关东最速计划”，甚至还十分专业地把赛道等资料罗列出来，该网站也就是那个车队的名字叫做“Project D”！枥木县S市“SEVEAN STARS”车队便是“D计划”远征的第一站。末次澈是“SEVE…