作恶多端的大鲨鱼Troy（多纳尔·罗格 配音）又回来了！这次他扬言要趁涨潮之日横扫整个珊瑚礁！曾经靠着自身力量而打败大鲨鱼的小鱼Pi（德雷克·贝尔 配音），这次将再次肩负起拯救大家的使命。但问题是，这次Troy不再是单人匹马，他身边多了几个跟随的爪牙，而且他本身也变得更加强大。于是在老海龟的建议下，Pi决定把身边几个愿意跟随的好友训…

在墨西哥的原始森林里，Sacha（艾丽西亚·希尔维斯通 配音）和Manu（德雷克·贝尔 配音）是一对十分要好的朋友，他们每天在丛林里奔跑嬉戏，活的自由自在，仿佛世间从未有过任何纷扰。生性活泼好动的Manu对一切充满了好奇，这天，他不小心弄坏了一尊雕像，这尊雕像原本是供奉给森林之神的，闯下大祸的Manu就这样遭到了驱逐，被逐出森林的Man…