我能做的事就只有杀人，将思念寄托于刀身冲田总司在冬季的京都奔驰着。庆应二年十二月，京都。冲田跟千鹤在巡逻时，得知一群潜伏在角屋的浪士，准备要攻击新选组驻在所。推荐千鹤前往调查的冲田，一边愉快的看着队士们吵闹，一边默默的握紧了手中的刀，决心要面对自己的疾病。

* 此篇乃是制作动画小组自行产出的剧情，并非原作者和月的构想。rr星霜篇故事发生于人诛篇约十多年后，晚年的剑心与神谷薰同患上不治之症，剑心在甲午战争（日本称为“日清战争”）时于中国失去记忆，最后左之助找到他并助他回到日本，最后剑心死于神谷薰的怀抱之中。故事前半主要以神谷薰的视点描述与剑心的往事，其间亦加插了少量人诛篇的回忆…

薄樱鬼即指土方岁三。此名为游戏土方线结尾土方与风间决战前风间所起。薄樱意为如樱花般绚烂而又转瞬即逝；鬼则指土方身为人类，却始终坚持贯彻自身信念，高洁之心令人钦佩，拥有能与鬼族平起平坐的强大实力与内心（风间是鬼族，一直对自己的鬼族身份感到骄傲，视罗刹为不伦不类的“伪物”）。其实新选组众成员又有哪个不是如此呢？

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幕府时代末期，外忧内患，山河动荡，百姓生活困苦，且生命时刻受到威胁。少年心太因其善良纯洁之心感动飞天御剑流高手比古清十郎，被其收入门下学习剑法，更名剑心。r在国家危难之际，年轻的剑心怀揣改变时代的梦想下山，加入奇兵队，日后更被桂小五郎纳入麾下，以刽子手的身份为时代的变革尽一份绵薄之力。年仅15岁的剑心接连刺杀多名政府要员…

　　明治11年夏天，维新重臣大久保利通突遭暗杀。在这起事件背后，前维新志士志志雄真实（池田政典 配音）的身影渐渐浮现。当年他曾接任剑心担任刽子手，却最终遭到维新政府的背叛险致丧命。从地狱活转过来的志志雄，如今开始慢慢揭开“京都破坏计划”的黑幕。为了阻止志志颠覆明治政府的阴谋，密探集团——京都御庭番众的首领•翁交给遗孤少女…

文久三年、冬。来到京城找寻父亲下落的雪村千鹤，突然遭到嗜血怪物的袭击。此时救了千鹤一命的，正是让人闻之色变的「杀人集团」新选组成员－冲田总司、斋藤一与土方岁三。在大雪纷飞的夜晚，千鹤与新选组纠缠的命运开始转动了。