解放战争时期，宋庆龄通过海外华侨将一大批军需药品秘密运往国内。然而船行至东海突然失踪。我党中央立即派人查找，国民党也出动海、陆、空三军进行搜查。原来药品被舟山群岛海盗司令方大雨劫走。为此，我党与国民党为了取得药品展开了机智的斗争，最后，方大雨被我党的精神所感动，决定将药品交还我军，并亲自护送药品投奔了我苏北解放区。

《神秘失踪的船》讲述了解放战争时期，宋庆龄通过海外华侨将一大批军需药品秘密运往国内，然而船行至东海突然失踪。我党中央立即派人查找，国民党也出动海、陆、空军前往搜杏。原来药品船被舟山群岛海盗司令方大雨劫持。海盗们不知箱中是何物，方大雨欲请恋人海曼的父亲弄清这批货。当他赶到鱼乡小镇，发现海曼的父亲惨遭地方女匪首王八妹的毒手…