十冻京是原本是一个快活的游泳少年，在千叶县的舞浜南高中上学，本应忙碌于恋爱和友情的他，有一天在神秘的转学生紫雫乃的引导下，被卷入了异世界的巨大机器人的战斗中。在反复的战斗中怀抱着各种疑问，并且苦恼着的京，为了保护自己与同伴而挺身投入了一场关乎世界存亡的战斗之中……

未来世界，人类被未知病毒“毒蛇”所毁灭，没有被“毒蛇”杀死的人被转换成了量子数据，并把所有数据资料转移到了分散于世界各地的量子服务器，生活在量子计算机中的虚拟世界。真实世界被“世界蛇”所控制，并不断建造实验场破坏地球。部分能够发现自己是生活在虚拟世界中的人们被称为“引导者”，他们的目标就是将所有数据化的人类重新还原到现…