未沙在地球的废墟中找到一块石板上记载着一首歌，这是一首数万年年在星际流传的情歌，在最后之战到来之际，以地球的命运为赌注，拯救了步向灭亡的人类，没错，是普通的情歌，在漫长的战争中，爱逐渐被人们遗忘了，变得只知道杀戮和战争，但是在他们的内心，确保留着对歌声的美好回忆，当这首情歌再度流动在燃烧着的战斗的宇宙中时，一切都变…

A.D.1999，由坠落地球的“谜之战舰”(之后被称之为Macross)带来的Over Technology(オーバーテクノロジー)，揭示了人类历史和远古文明 Proto Culture (プロトカルチャー)之间的丝丝联系。促使人类终止彼此间的战争，一方面面对强大的异星人势力 Zentraedi(ゼントラーディ)和Proto Deviln(プロトデビルン)，用“文化的力量”寻找生存…